Svrha je Fakulteta njegovanje, znanstveno istraživanje te sustavno i cjelovito izlaganje kršćanske Objave, unaprjeđivanje spoznaje njezine istine preko filozofsko-teoloških znanosti; odgoj i obrazovanje biskupijskoga klera, članova ustanova posvećenoga života, članova družba apostolskoga života i katoličkih laika; evangelizacija i inkulturacija kršćanstva kao i razvoj kršćanske filozofske i teološke misli, u suradnji s ostalim znanstvenim ustanovama; unaprjeđenje ekumenizma i razgovora sa svim kršćanima, promicanje dijaloga s nekršćanima i onima koji ne vjeruju, sa svijetom i kulturom.
Statut Fakulteta (čl. 9., § 1.)
Fakultet, u duhu slobode i u skladu s propisima Katoličke crkve, Zakona i Statuta Sveučilišta, svoje svrhe postiže poučavanjem i znanstvenim istraživanjem, suradnjom s drugim fakultetima, posebice s katoličkim bogoslovnim fakultetima u Splitu i Đakovu – njegujući interdisciplinarnost i čuvajući svoju samostalnost – prema odredbama Svete Stolice, posebnim središtima znanstvenoga istraživanja, znanstvenim publikacijama, kongresima i drugim znanstvenim susretima te aktivnom suradnjom svih svojih članova – nastavnika i studenata, prema svojim mogućnostima i sposobnostima.
Katolički bogoslovni fakultet ostaje stalno i trajno vjeran svojemu izvornomu i tradicionalno dobro prokušanu poslanju crkvene znanstvene i visokoškolske ustanove. Putem znanstveno-istraživačkih, znanstveno-nastavnih, umjetničko-istraživačkih, umjetničko-nastavnih i izdavačkih programa i projekata, na Fakultetu svojstvenim poljima znanosti i umjetnosti, nastavit će razvijati ozbiljna znanstvena i umjetnička istraživanja, odgajati i obrazovati cjelovitu ljudsku osobu koja svojim duhovnim, intelektualnim i moralnim vrlinama i kompetencijama može pridonijeti rastu Božjega kraljevstva na zemlji, vršenju poslanja mjesne i univerzalne Crkve i zajedničkomu dobru cijeloga hrvatskoga društva i zajednice europskih naroda i država.
Fakultet sebe vidi u budućnosti, kakvim je bio i u prošlosti – najvažniji i najizvrsniji nositelj znanstvenoga, istraživačkoga, nastavnoga, duhovnoga i kulturnoga rada na znanstvenim poljima filozofije, teologije i pastoralne teologije, religijske pedagogije, bioetike, socijalnog nauka Crkve i drugih srodnih humanističkih i društvenih znanosti te umjetničkoga rada na poljima glazbe, posebno crkvene glazbe čiji je jedinim nositeljem u Hrvatskoj. Katolički bogoslovni fakultet u Zagrebu želi u djelokrugu svojih kompetencija, u cjelokupnu znanstvenom, nastavnom, umjetničkom, publicističkom i stručnom djelovanju sudjelovati na oblikovanju, promicanju i provođenju nove evangelizacije u hrvatskomu narodu.
Kao najstarija i zasigurno najuglednija crkvena visokoškolska, znanstvena i odgojno-obrazovna teološka ustanova u Hrvatskoj i cijelomu hrvatskomu narodu, Fakultet ostaje vjeran i svjestan svoje odgovornosti da nastavi ostvarivati svoje poslanje na starim i novim osnovama, stoga će i dalje nastojati širiti Božje kraljevstvo i naviještati Radosnu vijest, promicati vjeru koja traži razumijevanje, promicati koncilsku obnovu Crkve, promicati duh ekumenizma i dijaloga te širiti ozračje snošljivosti, poštovanja, solidarnosti i odgovornosti, pripremati i odgajati studente za moralno odgovorno i kompetentno prihvaćanje budućih služba i obveza, promicati trajnu formaciju onih koji u Crkvi i u društvu obnašaju različite službe, uspostaviti suradnju s drugim znanstvenim i umjetničkim ustanovama, a na osobit način sa sastavnicama zagrebačkoga Sveučilišta, u skladu sa svojim kanonskim i akademskim statusom te evangelizacijskim poslanjem.
Svrha je Sveučilišta i Fakulteta formirati studente u katoličkoj nauci na razini visoke kvalifikacije u različitim disciplinama. Oni uvode slušače u dublja istraživanja, osposobljavajući ih za službu predavača na katedrama viših crkvenih studija, za istraživače znanosti ili pak za pastoralno djelovanje.
Sapientia christiana (br. 3)